[BETEPAH]

var arr =[],
    div = document.createElement('div');
div.innerHTML = 'Lorem <div>ipsum dolor</div> sit amet, consectetur <div>adipisicing elit</div>, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, <div>quis nostrud exercitation ullamco</div> laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat.';
[].forEach.call(div.querySelectorAll('div'), function(el) {
    arr.push(el.innerHTML);
});
console.log(arr);

с уважением к старым осликам:

var arr =[],
    temp,
    div = document.createElement('div');
div.innerHTML = 'Lorem <div>ipsum dolor</div> sit amet, consectetur <div>adipisicing elit</div>, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, <div>quis nostrud exercitation ullamco</div> laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat.';
temp = div.getElementsByTagName('div');
for (var i = 0; i < temp.length; i++) {
    arr.push(temp[i].innerHTML);
}
console.log(arr);