[jeka123]

var n = 4, m = 4,player = 2;
var pl_list_1 = [];
var pl_list_2 = [];
var sea = {};
 
for (var i = 0; i < m; i++){
    pl_list_1[i] = [];
    pl_list_2[i] = [];
    for (var j = 0; j < n; j++){
        pl_list_1[i][j] = getSea(sea);
        pl_list_2[i][j] = getSea(sea); 
        
}}
for (var z = 1; z <= player; z++){
do {
    var x = prompt(z+' Игрок\nВведите координты кораблей по X');
    var y = prompt(z+' Игрок\nВведите координты кораблей по Y');
    message = confirm(z +' Игрок вы продолжаете ввод?');
     putship(x,y,z);
   } while (message ===true);
}
alert('Война началась!(^(*_*)^)');
do {
   for (var z = 1; z <= player; z++){
    var firex = prompt(z+' Игрок\nОгонь по  координатам по X');
    var firey = prompt(z+' Игрок\n Огонь по  координатам по Y');
    fire(firex,firey,z);
    }
   } while (haschip(n,m) === true);
// WhoWon();
 console.log(pl_list_1);
 console.log(pl_list_2);
 
 
 
function putship(x,y,pl_id){
  if(pl_id == 1){
  pl_list_1[x][y].chip = true;
  }else if(pl_id == 2) {
    pl_list_2[x][y].chip = true;
  }
  }
function getSea() {
    return {
        chip :false,
        opened:false,
        msg:'Промазал'
    };
}
function haschip(x,y){//всеравно тут false возвращает (( не находит
for(var i=0;i<x;i++){
for(var j=0;j<y;j++){
  alert(pl_list_1[i][j].chip);
/*if (pl_list_1[i][i2].chip === true){
 alert(pl_list_1[i][i2].chip); 
 return true;
}else {
alert(pl_list_1[i][i2].chip); 
return false;
}
*/
}
}
}
function fire(x,y,pl_id){
if(pl_id == 1){
  if (pl_list_2[x][y].opened === true) {
    alert ('Вы сюда уже стреляли!!!');
    pl_list_2[x][y].msg = 'Тут уже огромная дыра';
  }else if (pl_list_2[x][y].chip === false){
     alert ('МИМО (^(*_*)^)!!!');
    pl_list_2[x][y].msg = 'Тут уже огромная дыра';
  }else{
  pl_list_2[x][y].opened = true;
  if (pl_list_2[x][y].chip === true){
    pl_list_2[x][y].chip = false;
    alert('Корабль Игрока 2 Уничтожен (^(X_X)^)!!!');
  }
  }
  }else if(pl_id == 2) {
  if (pl_list_1[x][y].opened === true) {
    alert ('Вы сюда уже стреляли!!!');
    pl_list_1[x][y].msg = 'Тут уже огромная дыра';
  }else if (pl_list_1[x][y].chip === false){
     alert ('МИМО (^(*_*)^)!!!');
    pl_list_1[x][y].msg = 'Тут уже огромная дыра';
  }else{
  pl_list_1[x][y].opened = true;
  if (pl_list_1[x][y].chip === true){
    pl_list_1[x][y].chip = false;
    alert('Корабль Игрока 1 Уничтожен (^(X_X)^)!!!');
  }
  }
  }
}
/*
function WhoWon(){
for(var i=0;i<x;i++){
for(var i2=0;i2<y;i2++){
if (pl_list_1[i][i2].chip !== true){
alert('Победа игрока 2!!!!!!');
}
else if  (pl_list_2[i][i2].chip !== true){
alert('Победа игрока 1!!!!!!');
}
}
}
}*/

сделал как вы сказали в функции haschip но не находит( мне это для цикла нужно проверять есть корабли или нет)