xTODx,
При первичной загрузке страницы включаем сразу(ставим флаг загрузки), далее следим за потерей - восстановлением фокуса
window.onblur = отключаем
window.onfocus = включаем
=======================
3. Подстраховать, пусть сам setInterval , внутри которого функция тестирует флаг blur
$(document).ready(function(){blur =false;});
$(window).blur(function() { blur =true; clearInterval(sliderTimer);});
$(window).focus(function() {
blur =false;
sliderTimer=setInterval(function(){ if(blur){clearInterval(sliderTimer); return} ;nextSlide();}, intervals);
});