[kolka]

1. Никогда вообще с этим не было проблем
2. По Sencha CMD я тут все учил. Очень много настроек можно править в app.json.. по этому файлу настроек вообще отдельный мануал у них.
3. sencha generate [app|controller|form(Sencha Touch Specific)|model |package|profile(Sencha Touch Specific)|theme|view|workspace]