Можно сконфигурировать app.json:
"output": {
        "base": "${ext.dir}/build/examples/kitchensink",
        "page": "index.html",
        "manifest": "${build.id}.json",
        "js": "${build.id}/app.js",
        "resources": {
            "path": "./${build.id}/resources",
            "images": "./${build.id}/resources/images",
            "shared": "./resources",
            "toolkit": "${toolkit.name}/resources",
            "base": "."
        },
        "deltas": {
            "enable": false
        },
        "appCache": {
            "enable": false
        }
    },
Это кусок из app.json, взятого из примера KitchenSink. Там много чего ещё есть интересного. :)