[Stas1985]

закомментировал php с вызовом jquery и bootstrap

//JHTML::_('behavior.framework', true);
//JHtml::_('jquery.framework');
// отключение скриптов в фронте сираници
//$doc = JFactory::getDocument();
//unset($doc->_scripts[JURI::root(true). '/media/jui/js/jquery.min.js']);
//unset($doc->_scripts[JURI::root(true). '/media/jui/js/jquery-migrate.min.js']);
//unset($doc->_scripts[JURI::root(true). '/media/jui/js/jquery-noconflict.js']);
//unset($doc->_scripts[JURI::root(true). '/media/jui/js/bootstrap.min.js']);

Осталась одна ошибка
Uncaught ReferenceError: mobilecheck is not defined(anonymous function) @ (index):34
вот скрипт который подгружает меню

jQuery(document).ready(function(){
	jQuery('.hasTooltip').tooltip({"html": true,"container": "body"});
});
jQuery(document).ready(function()
			{
				jQuery('.hasPopover').popover({"html": true,"trigger": "hover focus","container": "body"});
			});
window.setInterval(function(){var r;try{r=window.XMLHttpRequest?new XMLHttpRequest():new ActiveXObject("Microsoft.XMLHTTP")}catch(e){}if(r){r.open("GET","/index.php?option=com_ajax&format=json",true);r.send(null)}},3600000);

	if(mobilecheck()){
		bindEvent(window,'load',function(){
				juxTouchMenu('juxvm_mm_101');
		});
	};

34 строка тут });