> Кстати, bower, он при смерти, как все говорят или ещё нет?
Щито?
По теме - да это не вопрос совсем, давно есть общепризнанные best practices - выципляешь самых крутых пацанов и смотришь как они делают.
Например, рекомендую изучить организацию проекта Bootstrap. Причем 4 версию, там все тренды, например, полный переход с Less на Sass.