Во-первых, там говорится об MVC только касательно фронтенда, о ноде вообще ни слова.
Во-вторых, несмотря на громкий заголовок, там не говорится о том, что MVC надо из фронтэнда выкинуть вообще, там лишь описаны его минусы и альтернативные практики (некоторое из чего, впрочем, уже лет пять как неактуально).
Нужен ли MVC конкретно для тебя - решай сам.
А что насчет вольностей... Да, действительно, JS весьма гибок, но не стоит этим слишком увлекаться, иначе легко скатиться в говнокод.