maza2,
прочитайте статью еще раз, и внимательно. по слогам.
до полного понимания происходящего.
когда поймете, что JS выполняется в браузере, а PHP на сервере, и что запускать PHP-шный код из JS непосредственно нельзя, прочитайте
эту статью
с помощью нее вы узнаете, как можно послать запрос на сервер к определенному файлу, не перезагружая страницу
этим файлом вполне может быть PHP-файл с необходимым вам кодом
PS Java и Java Script -разные, ничем не связанные языки. называйте их правильно