Мне кажется, проще будет не исключать код из боевой версии, а наоборот - включать дополнительный код в отладочную.
Сделать это можно в app.json:
"development": {
"js": [{
path: "app/store/AjaxSimulation.js"
}]
}
В KitchenSink есть примеры разных директив для отдельных сборок.