Значит структура данных совсем иная, ибо в том как было показано $d не является объектом. Ну это если объявить например так:
$a = ['db' => (object)[
'soсial' => [
'linkedin' => 'http://www.linkedin.com/',
'facebook' => 'https://www.facebook.com',
'google' => 'https://plus.google.com/'
]
]
];
var_dump($a);
//объектом будет social, а показанный код вернет требуемое
echo json_encode(array_values(current($a['db'])));
//а в вашей структуре нужно так
echo json_encode(array_values($d->social));