в один файл
по возможности минимизировать
http://closure-compiler.appspot.com/home
и сжать
http://compressorrater.thruhere.net/
мы же разработчики используем для данных целей сборщики(плагины)
интегрированные в IDE (YUI compressor, UglifyJS ...) или включаемые в пакет разработки плагины к примеру
https://learn.javascript.ru/screencast/webpack