На счет того что вопрос хранится под ключами id это верно. Но как мне его передать(как показано в вашем примере), если он(вопрос к ключ к нему) формируется только после отправки запроса subit(тут контроллер должен получить вопросы с ответами и добавить их в базу)?
<form>
<h4>Вопрос #1
<input type="text" name=question[0]/>
<div class="answer">
<input type="radio" name="answer[??]">
</div>
</form>