Для управления внешними и внутренними устройствами в архитектуре ПК существуют коммуникационные порты более известные как COM LPT USB NET\Enternet SAS IDE ATA SATA PATA PCI PCIE VGA HDMI и так далее и тому подобное ... любые штырьки и разъемы на материнской плате по сути являются коммуникационными портами служащие для соединения различных устройств друг с другом. Но для управления большинством из этих портов требуется специальный драйвер работающий из режима ядра.
Самый простой способ мигнуть светодиодиком это COM порт. При попытки открыть COM1 как обычный файл он даст 5 вольт на один из контактов что обычно вполне достаточно.
Еще колхозный способ это механические устройства ) подключаешь флопик/сидиром/HDD к ним можно также получить доступ через файловую подсистему и дальше насколько хватит фантазии.
<iframe src="https://youtu.be/9h5bEEv0iSc?list=PL44C2614808EB920E" ></iframe>
По большому счету вопрос задан не на том форуме нужен форум электронщиков и по хорошему нужно смотреть в сторону микроконтроллеров или уже готовых решений на базе ардуинки.