sergey24, если клик регистрируется не элемент которого не существует, а он появляется после вызова, то явно не сработает. Всегда ищи в доках функции коллбэки.
var c = $('<div class="box-modal" />');
    c.html($('.b-text').html());
    c.prepend('<div class="box-modal_close arcticmodal-close">X</div>');
    $.arcticmodal({
        content: c,
        afterOpen: function() {
         $('.class').on('click', function(){
           alert();
         });
        }
});