А JS тут причем?
$quotes[] = 'Вариант 1';
$quotes[] = 'Вариант 2';
$quotes[] = 'Вариант 3';
.....
Что так 1000 элементов и будете прописывать? Сразу и пишите, причем начиная с версии 5.4 можно так:
$quotes = [
'Вариант 1',
'Вариант 2',
'Вариант 3',
....
];
В версиях до нее с обязательным объявлением array(elm, elm, ....)
srand ((double) microtime() * 1000000); - это требовалось в древних версиях РНР.
А случайно выбрать несколько из массива, это читать тут
http://fi2.php.net/manual/ru/function.array-rand.php