<?php
for ($x=0; $x<=11; $x++){//поменять на это!!!
for ($y=0; $y<=11; $y++){////поменять на это!!!
$mapelements.="<div style='position: absolute; left:".($x*50)."; top:".($y*50)."; width:50px; height:50px; background-color:#CCCCCC' id='x".$x."y".$y."'></div>";
}
}
?>
<table width="550" height="550" border="0" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0">
<tr>
<td style = "position:absolute" align="left" valign="top" bgcolor="#FFFFCC"><?php echo $mapelements;?></td>
</tr>
</table>
попробуйте так
Правда, не знаю, можно ли так ячейку позиционировать, может туда div засунуть, и его спозиционировать