Как бы вопросов по остальным запросам на сервер нет.
Сразу во все прописал данный заголовок:
Ext.Ajax.setDefaultHeaders({
'Authorization': 'Bearer ' + localStorage.getItem('access_token')
});
Все работает норм.
Вопрос именно по отправке файла. Открывается новый iframe в котором както отправляется файл при этом никаких заголовков не добавляется