Если открыть изображение (Сtrl+O), то перед его открытием всплывает диалоговое окно в котором спрашивается, с каким разрешением вы хотите его открыть? Очевидно вы даже не прочитав, что там написано, нажали OK!
Так вот, там 2 варианта, где Image DPI...
- From File, выберите, если нужно как в файле
- Default import resolution, выберите если нужно разрешение, указанное в Preferences.
В диалоговом окне Preferences (Shift+Ctrl+P) выберите слева раздел Bitmaps и укажите Default import resolution: 96 dpi. Также проверьте, стоит ли у вас галочка рядом с Ask about linking and scaling when importing, если нужно.