[voraa]

А что именно не работает?

Но так правильнее будет

let sum = () => {
	let a, b;
	const proverka = x => x.length > 0  && !isNaN(+x);

	do {
		a = prompt("Введите первое число");
		if (a===null) return false;
	} while (! proverka(a.trim()))

	do {
		b = prompt('Введите второе число');
		if (b===null) return false;
	} while (! proverka(b.trim()))
	
	a -= 0;
	b -= 0;
	
	alert (a === b ? 'Числа равны' : a < b? 'Первое число больше второго' : 'Второе число больше первого');
	return true;
}

while (sum());