laimas,
Спасибо за помощь. Посмотрел ваше видео, у вас отрабатывает так как нужно.
Положил готовый pdf на сервер, на кнопку повесил href. В этом случае отрабатывает как надо, файл скачивается в любой момент времени.
В моем же случае, вида
window.open("/get_pdf.php", "_blank");
отрабатывает не так как хотелось бы.