[voraa]

есть ли возможность поймать событие клик по номеру (маркеру), а НЕ содержимому li

Нет

checkbox, что бы я мог отмечать определенные строки, при этом сами строки будут содержать в том числе ссылки, т.е. должны быть юзабельны.

А почему не chekbox и просто строка рядом?

я не хочу

Программе это все равно.