[Sice]

Sice,
https://api.jquery.com/load/
в jquery load есть параметр complete туда и вставьте $('.myPopover').popover...

Перестала работать перезагрузка и всплывающие подсказки, наверное сделал что-то не так

<script>
        setInterval(function() { 
            $('#main').load(window.location.href + ' #main',
         $('.myPopover').popover({
         html : true,
         content: function() {
          var elementId = $(this).attr("data-popover-content");
          return $(elementId).html();
         }
         });
)
        }, 10000)    
    </script>