Неужто same-origin policy?!
Допустим, вы обращаететсь к основной странице как
что-то-там/index.html, тогда если написать:
var newWin = window.open("*!*что-то-там/*/!*dotter.html", "_blank" , params)
то в хроме начинает работать. В опере - не начинает.
Еще одна причина ненавидеть попапы
