если я правильно понял конечно
можно в значении переменной до ее передачи заменить все переводы строк например на "###"
$HTML=preg_replace(/[\r\n]/g,'###')
а при получении переменной обратное
$HTML=preg_replace('###','\r')
а хотя если передается HTML то можно вообще убрать все переходы строк