Я думаю что нужно узнать расстояние от вашего элемента до верха iframe (пусть elemTop), и потом сравнивать длину скролла этого родительского окна с расстоянием от его верха до iframe + elemTop - родительское_окно.clientHeight, я наверно ошибся что с чем складывать
так в голове прикинул, но тут простая математика