вообще, у вас там ошибочка. И негоже функцию без {} объявлять
<script type="text/JavaScript">
function Time(){
setTimeout( function(){window.open("defrag.html", "_blank", "height=200, width=500, top=200, left=250, menubar=no, location=no, toolbar=no, directories=no, resizable=no, scrollbars=no, status=no")}, 3000);
}
</script>