а может дело то не в input'ах, может дело в этом:

var temp=eval('tatarcha.alphabet.'+document.getElementById('combo_1').value);

или

var temp=eval('tatarcha.alphabet.'+document.getElementById('combo_2').value);

что это за данные, и откуда они берутся, и вы уверены что там все как надо?

devote,
Да, там всё как надо. Происходит вызов массива.

Приношу свои извинения. Проблема была именно в temp=eval...
Вывел его значение и оно равно undefined. Не додумался вывести его значение, из за того, что работает в других браузерах.
Большое спасибо за помощь!

Опять соврал=) Проблема была не в eval. А в индексаторе temp[i]. Видать в IE это не проходит. Пришлось использовать charAt(i).