JS не работает с классами?

[hoax]

var one = document.getElementsByClassName('one');

document.body.removeChild(one);

ничего нет. даже если использовать for по классу

[Aetae]

.getElementsByClassName

Вы получаете NodeList - массивоподобный объект, а .removeChild принимает конкретный элемент.
Например:

var one = document.getElementsByClassName('one')*!*[0]*/!*;
document.body.removeChild(one);