Это смешно даже сравнивать.
Я имею ввиду низкоуровневую обработку готовых аудио/видео потоков. file API не умеет делать архивирование и упаковку файлов. Попробуйте сделать менеджер загрузки или torrent-client на JS.

monolithed, безусловно, этого сделать нельзя. Но вам часто нужен torrent-клиент в браузере? А на flash его можно сделать? Равно как и упаковку файлов. Это чистый интерес, кстати, о возможностях флеша я не очень осведомлён.

И вообще, JS вроде как активно развивается. Два года назад не было и тех зачатков fileAPI, что сейчас есть.

Да, сейчас использую NaCl клиент в Сhrome.
Конечно.
Это самая востребованная функция. К примеру, вы торгуете музыкой, купить можно не только трек, но и альбом целиком.
Сейчас приходися делать запрос на сервер для архивирования файлов или брать уже готовый архив, однако бывают ситуации когда контент не твой и правообладатели не дают возможности загружать файлы к себе на сервер. И тут либо писать плагин для браузера, либо фреш-приложение либо вообще забить на это безнадежное дело и отдавать только треки.
Драфт появился в 2006, однако возможности fileAPI пока тоже "детские"

Теоретически нет вообще никаких ограничений, т.к. любой модуль можно написать на С++.

Понятно, спасибо)

И что делается в этой ситуации с файлами?

Как правило файлы не отдают, только ссылки, после подтверждения факта покупки. Некоторые отдают даже ссылки на архив, но нельзя прогназировать время упаковки (иногда у них сервак падает или скрость отдачи медленная).
Причем в случае неудачной загрузки кто-то дает возможность повторно загрузить файл (до 5 раз в течении 24-72ч), а кто-то нет. Вообще медийный рынок очень сложный.

Я думал тут будет что-то про упаковку файлов флешом.

Да есть такое решение, как-правило, для архивирования используются FZip или ASZip.
Но ввиду того что поддержка flash на мобильных платформах переживает не лучшие времена, а именно iOS и новая версия WinMobile не имеют поддержки flash, приходится искать извращенские альтернативы.
Где-то читал, что Chrome и Safari на десктопах планируют отказаться от flash, в safe-build IE10 тоже его не будет((
Вобщем закапывают технологию, а серьезных аналогов пока нет.

Про этот браузер вообще ещё неизвестно, что там будет))

Кстати, а разработку Gazelle (или во что они там его переименовали) в MS прекратили?