Лишняя обертка

[PeaceCoder]

Prototype же возвращает сам DOM-объект с добавленными методами.

Первое почему я отсеял прототайп фреймворк из использования изза этого.
Стоит только переписать прототип под свой фреймворк как прототайп летит к чертям и наоборот.

[tenshi]

не все узлы можно расширить в ие, поэтому универсальнее использовать обёртку

прототипы стандартных классов - это те же глобальные переменные, но вид сбоку. могут возникнуть конфликты между фреймворками