Запускаем от имени администратора редактор реестра.
Ищем ветку HKEY_CLASSES_ROOT
В этой ветке ищем раздел .JS выделяем и удаляем его.
Создаем файл с любым именем и расширением .reg
В файл записываем:
[HKEY_CLASSES_ROOT\.JS]
@="JSFile"
Сохраняем и закрываем файл.
Двойной щелчок по файлу и соглашаемся с добавлением в реестр.
И все должно работать.