Способ преобразования мне не подходит, т.к. работать нужно с массивом, а гонять данные туда-сюда не хорошо.
Перечитывая документацию по jinja2 увидел там ключик(или как они называются) |safe.
используя его, нет никаких ошибок и все работает корректно:
console.log({{ data|safe }})
Всем спасибо, тему можно считать закрытой