остановить таймер
 

В одном из методов запускаю таймер командой.

a1 = setTimeout(Change, tt * 500);

При нажатии на кнопку запускается функция в которой этот таймер останавливается кодом

clearTimeout(a1);

Почему не работает?

setTimeout выполняет код только один раз
http://javascript.ru/setTimeout

Блин, просмотрел. Пытаюсь через флаг.

if (viiti == 1){
                return;
            }

viiti присваиваю 1, там где раньше был clearTimeout. Тоже что-то не очень.

Vladimir93, может Вы имели ввиду setInterval?

У меня происходит рекурсия, поэттому сдесь setTimeout нужно

Change();
        function Change() {
            if (viiti == 1){
                return ;
            }
            else {
                var cc = CLR.shift();
                CLR.push(cc);
                var tt = TMR.shift();
                TMR.push(tt);
                d.style.backgroundColor = (cc.charAt(0) == 1) ? '#FF0000' : '';
                d1.style.backgroundColor = (cc.charAt(1) == 1) ? '#FFFF00' : '';
                d2.style.backgroundColor = (cc.charAt(2) == 1) ? '#00FF00' : '';
                setTimeout(Change, tt * 500);
            }

        }

Change();
        function Change() {
            if (viiti == 1){
                return ;
            }
            else {
                var cc = CLR.shift();
                CLR.push(cc);
                var tt = TMR.shift();
                TMR.push(tt);
                d.style.backgroundColor = (cc.charAt(0) == 1) ? '#FF0000' : '';
                d1.style.backgroundColor = (cc.charAt(1) == 1) ? '#FFFF00' : '';
                d2.style.backgroundColor = (cc.charAt(2) == 1) ? '#00FF00' : '';
                *!*a1 = */!* setTimeout(Change, tt * 500);
            }

        }

Кабэ очевидно. Таймаут то уже другой.