как сделать что бы при нажатие на ссылку в модальном окне, окно закрывалась и ссылка открывалась уже в главной странице

target="_top"
Или отказаться от фрейма в пользу аякс подгрузки. Но это может быть не просто сделать. Завтсит от движка сайта.

Спасибо! все получилось