В IE наверное только при помощи ActiveX? Тогда можно и плагин к FF написать, только вот сложноватая разработка получается))

да.

Какой реестр?
Давайте более конкретно, надеюсь вы понимаете что речь идет о linux(а точнее о ubuntu 9.10), не могли бы вы уточнить точное место?

В общем в продолжение темы(нашел в mdc):

Как все происходит в Gecko: когда юзер открывает страницу
1. ищутся совпадения по MIME type
2. грузиться код плагина в память (в моем случае грузятся разные)
3. происходит инициализация плагина
4. создается новый экземпляр плагина

Настройки они используют одни, толи в профиле, толи в системе. Накопаю где они все это хранят отпишусь.

Хз, в линухах не шарю, но наверняка там есть некий более разумный аналог сей помойки.)

своя помойка, только поменьше :)

в общем все оказалось банально:
http://en.wikipedia.org/wiki/Local_Shared_Object