dixonich,
Лучший способ - наращивать id у кадого нового мячика - по пуску - для каждого лично запускать свой таймер проверки и по окончании движения - обязательно его удалять
установка-удаление таймера
var intervalIDNum1 = setInterval(...)
clearInterval(intervalIDNum1)
http://javascript.ru/setInterval
Для каждого таймера - свой идентификатор