На самом деле этот элемент хоть и стандартизован, но его применение неформально имеет статус
depricated и как следствие в XHTML Strict он запрещен. Также стоит отметить, что раньше содержимое в этом элементе индексировали ПС (может и сейчас тоже, незнаю).
Лучше всего делать так:
<div id="noscript">ВНИМАНИЕ: Ваш браузер не поддерживает работу с JavaScript!</div>
<script type="text/javascript">
document.getElementById('noscript').style.display = 'none';
</script>