Вообще для перехода по ссылке в нужный фрейм есть атрибут target:
<a href="…" target="идентификатор_фрейма">…</a>
Если нужно с помощью JavaScript, то, наверное, нужно найти в коллекции top.frames нужный фрейм и изменить его src.
А вообще все эти фреймсеты — прошлый век, так уже давно никто не формирует странички.