BETEPAH,
var text = '111<span id="p_e5b07485b818e7d788732d6946ae095b" class="popup" style="display: none;"><a class="close" href="javascript:void(0);"></a>66666666666</span></span>';
alert(text.split(/<span.*?>/, 1));
и суть не в этом. А в том, что надо получить, а не заменить