По идее так. Но у меня в опере 10 валую файла видит как C:\fake_path\
Попробую так
<script type="text/javascript">
function runProgram(appName){
alert(appName);
document.getElementById('programRunFrame').src='file://'+appName;
}
</script>
<iframe id="programRunFrame" style="display:none;"></iframe>
Введите букву вашего системного диска
<input type="text" id="sDisk" value="C" />
<br />
<button onclick="runProgram(sDisk.value+':\\Windows\\system32\\dxdiag.exe');">Запустить dxdiag.exe</button>