HTML заменяемый в Javascript'e должен быть в одну строку.
<!DOCTYPE HTML>
<html>
<head>
<script src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1/jquery.js"></script>
</head>
<body>
<div id="regForm"></div>
<script>
$('#regForm').replaceWith("<div id='userForm'><div id='userInfoBox'><span id='userName'>Username</span></div><div id='userLogoBox'><img width='80' height='80' src='img/userLogo.png' /></div></div>");
</script>
</body>
</html>